Phương pháp liên quan đến việc sử dụng của các enzyme giới hạn để cleave DNA tại trang web cụ thể, cho phép các phần của các phân tử ADN để được chèn vào các plasmid hoặc khác vector và nhân bản trong một sinh vật máy chủ lưu trữ thích hợp (ví dụ như các tế bào một vi khuẩn hoặc nấm men).