Методи, пов'язаних з використанням обмеження ферментів, сколите ДНК в конкретні сайти, дозволяючи розділи молекул ДНК, щоб вставити у плазміда або інші вектори і клоновані ворганизме відповідні хоста (наприклад, бактеріального або дріжджів клітинки).