Olan bir double-strand oluşturma bir dna sarmalı içinde belirli temel dizileri tanımak endonucleases dna bölünürler.

Not: enzimler bu tanıma sitelere bağlamak ama sonradan farklı sitelerde dna kesim kısıtlama yazın. Tip II enzimleri hem bağlamak ve tanıma ya da hedef sitelerindeki içinde kesilmiş.