V WebSphere MQ, množina programovacích rozhraní, ktoré umožňujú zákazníkov alebo dodávateľov písať programy, ktoré rozšírenie alebo nahradenie niektorých funkcií v WebSphere MQ výrobky. Rozhrania sú nasledovné: údaje konverzie rozhranie (DCI), správa kanálov interface (MCI) názov rozhrania služby (NSI) zabezpečenie umožňujúce rozhranie (SEI), spúšť monitor rozhranie (TMI).