În curs de reparare bază de excizia, o bază modificat este eliminată de o enzimei de glycosylase a ADN-ului, urmată de excizia fosfatului de zahăr care rezultă. Decalajul mici stânga în helix ADN-ul este completat prin acțiunea secvenţiale polimeraza ADN-ului şi ADN-ul ligase.