Początkowa wycena używane jako podstawa do porównania przyszłych. Dla osób zarażonych HIV, badania według planu bazowego zawiera CD4 licznik, wirusowe obciążenia (HIV RNA) oraz badania odporności. Linii bazowej, wyniki badań są używane do wybory leczenia HIV i monitorowania skuteczności antyretrowirusowe terapii (sztuka).