Molekulām, kas atrodas gandrīz katru ķermeņa šūnu virsmas grupai. Galveno histocompatibility komplekss (MHC) molekulu klāt olbaltumvielu fragmenti (peptīdu) imūnsistēmas šūnām. Ja šūnas atzīt peptīdu ārvalstu , ķermeņa stiprinājumu imūnās atbildes reakcijas. Cilvēkos, MHC molekulas sauc par cilvēka leikocītu antigēnu (HLAs).