1) שיטת הפרדת מולקולות גדולות (כמו למשל קטעי DNA או חלבונים) מתערובת של מולקולות דומות. חשמלית זרם מועבר באמצעות מדיום המכיל את התערובת ולאחר כל סוג של מולקולה עוברת דרך המדיום בקצב שונה, בהתאם את המטען החשמלי ואת גודל. מוצקים Agarose ואקרילאמיד הם התקשורת הנפוץ עבור אלקטרופורזה של חלבונים וחומצות גרעין.

2) בג'ל היא טכניקה המעבדה המשמשת להפרדת מולקולות DNA, RNA או חלבון בהתבסס על גודל המטען החשמלי שלהם. חשמלית הנוכחי משמש להעברת מולקולות יופרדו דרך ג'ל. נקבוביות בעבודה ג'ל כמו נפה, ומאפשר מולקולות קטנות לנוע מהר יותר מולקולות גדולות יותר. ניתן לכוונן את התנאים לשימוש במהלך אלקטרופורזה להפרדת מולקולות בטווח הגודל הרצוי.