Segmen berulang dalam urutan yang sama dari beberapa triplet kodon masing-masing segmen bervariasi antara 14 dan 100 pasangan basa, berguna sebagai penanda linkage karena sifat mereka sangat polimorfik dan fakta bahwa mereka biasanya terletak di dekat gen. Mini-satelit secara inheren tidak stabil dan rentan terhadap mutasi pada tingkat yang lebih tinggi daripada urutan lain DNA.