Liaison d'une substance, ou de ses métabolites d'une phase I réaction, avec des molécules endogènes (conjugaison), faisant plus de dérivés hydrosolubles qui peuvent être excrétées dans l'urine ou la bile.

Note : La Phase réactions II comprennent la glucuronidation, sulfatation, acétylation, acides aminés (p. ex., glycine) et conjugaison de glutathion.