1. De la contracción de la frase "genotipo haploide", la constitución genética de un individuo con respecto a uno de los miembros de un par de genes alélicas: haplotipo puede hacer referencia a un único locus o un genoma completo (un haplotipo de todo el genoma que comprenden la mitad de un genoma diploide, incluyendo un alelo de cada par de genes alélica).

2. Conjunto de polimorfismos de nucleótido simple para ser estadísticamente asociados en una sola cromátida.