Segments répétés de la même séquence de plusieurs codons de triplet, chaque segment variant entre 14 et 100 paires de bases, utiles comme marqueurs de liaison en raison de leur nature hautement polymorphe et le fait qu'ils sont généralement situés près des gènes. Minisatellites sont intrinsèquement instables et sensibles à la mutation à un taux plus élevé que les autres séquences de l'ADN.