كسر اندونوكليسيس التي تعترف بتسلسل قاعدة محددة داخل الحلزون الحمض النووي، خلق ازدواجية حبلا من الحمض النووي.

ملاحظة: النوع الأول من تقييد الإنزيمات ربط هذه المواقع الاعتراف ولكن بعد ذلك قطع الحمض النووي في مواقع مختلفة. "النوع الثاني" تقييد الإنزيمات سواء الربط وقطع داخل مواقعها على الاعتراف أو الهدف.